Στην αρμοδιότητα των οικονομικών εισαγγελέων είναι η άρση ή μη της προστασίας των μαρτύρων στην υπόθεση του πρώην υπουργού Δημήτρη Παπαγγελόπουλου.
Αυτή ήταν η κρίση του δικαστικού συμβουλίου του ειδικού δικαστηρίου, το οποίο συνεδρίασε για το θέμα των προστατευόμενων μαρτύρων που είχε τεθεί με την πρόταση της αντεισαγγελέως του Αρείου Πάγου Βασιλικής Θεοδώρου.
Η εισαγγελική λειτουργός είχε εισηγηθεί τον αποχαρακτηρισμό των δύο μαρτύρων στην «υπόθεση Παπαγγελοπούλου» με το σκεπτικό ότι η προστασία τους αφορούσε μόνο την βασική υπόθεση της Novartis. Μετά από αυτή την εξέλιξη σήμερα συνεδρίασε τον δικαστικό συμβούλιο του Ειδικού Δικαστηρίου, τα μέλη του οποίου έκριναν ότι οι εισαγγελείς που έχουν την αρμοδιότητα για τη διαφθορά και το οικονομικό έγκλημα είναι εκείνοι που θα αποφασίσουν για την τύχη των προστατευόμενων μαρτύρων.